MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	ATAAA	2	10	63	72	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018744	ACT	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018744	A	7	7	144	150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018744	GAA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018744	A	6	6	185	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018744	T	6	6	5612	5617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018744	ATT	3	9	5666	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018744	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018744	TAT	2	6	5721	5726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018744	TCT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018744	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018744	A	6	6	5847	5852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018744	TAT	2	6	5853	5858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018744	AGG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018744	ATTAC	2	10	7820	7829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018744	A	6	6	7860	7865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018744	GAC	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018744	CAAA	2	8	7943	7950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018744	ACT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018744	T	6	6	7965	7970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018744	TAA	2	6	7981	7986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018744	TAAAA	2	10	8002	8011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018744	TAT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018744	ATA	2	6	8080	8085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018744	ACA	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018744	CCAT	2	8	8131	8138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018744	TA	4	8	8155	8162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018744	AG	3	6	8185	8190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018744	ACT	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018744	TAT	2	6	8226	8231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018744	AGTA	2	8	8244	8251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018744	A	6	6	8256	8261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018744	CTAT	2	8	8266	8273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018744	TAT	2	6	8290	8295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018744	A	6	6	8320	8325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018744	CTAT	2	8	8330	8337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018744	ATTG	2	8	8408	8415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018744	T	6	6	9826	9831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018744	TAT	2	6	9845	9850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018744	AATA	2	8	9886	9893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018744	TAAA	2	8	10217	10224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018744	AT	3	6	10234	10239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018744	AAGT	2	8	10247	10254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018744	A	6	6	10286	10291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018744	TGTT	2	8	10292	10299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018744	GTA	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018744	TTGG	2	8	10412	10419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018744	AGGT	2	8	10451	10458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018744	TTG	2	6	11455	11460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018744	A	6	6	11465	11470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018744	ATT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018744	GCAA	2	8	12437	12444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018744	ATT	2	6	12519	12524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018744	TTGT	2	8	12525	12532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018744	A	6	6	12612	12617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018744	ATTA	2	8	12629	12636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018744	CTG	2	6	12662	12667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018744	TGT	2	6	12703	12708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018744	CAG	2	6	13824	13829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018744	T	6	6	13903	13908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018744	GAA	2	6	13925	13930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018744	AAT	2	6	13962	13967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018744	CTA	2	6	14007	14012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018744	TGAA	2	8	14074	14081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018744	T	6	6	14786	14791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018744	ATC	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018744	T	6	6	17732	17737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018744	A	6	6	17742	17747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018744	TTG	2	6	17777	17782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018744	ATG	2	6	19869	19874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018744	ATTTT	2	10	19914	19923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018744	AAT	2	6	19954	19959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018744	AT	3	6	19996	20001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018744	AAT	2	6	20025	20030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018744	A	6	6	20113	20118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018744	ATTGT	2	10	20124	20133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018744	TAA	2	6	20152	20157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018744	TAG	2	6	20221	20226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018744	AGT	2	6	20303	20308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018744	AGA	2	6	20323	20328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018744	CTT	2	6	20350	20355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018744	ATAAAT	2	12	20981	20992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018744	TAAT	2	8	20999	21006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018744	ACA	2	6	21009	21014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018744	A	6	6	21047	21052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018744	CAA	2	6	21064	21069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018744	TTTA	2	8	21094	21101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018744	AAT	2	6	21130	21135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018744	T	6	6	21994	21999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018744	ATA	2	6	22030	22035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018744	ATT	2	6	22043	22048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018744	AGT	2	6	22068	22073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018744	A	9	9	22074	22082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018744	ATTAT	2	10	22101	22110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018744	AAT	2	6	24039	24044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018744	ATT	2	6	24083	24088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018744	AAT	2	6	25011	25016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018744	TGT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018744	ATG	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018744	AGT	2	6	25182	25187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018744	AGAA	2	8	25214	25221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018744	AT	3	6	25229	25234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018744	ACT	2	6	25271	25276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018744	TTA	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018744	A	6	6	25345	25350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018744	A	6	6	25390	25395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018744	GTAC	2	8	25400	25407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018744	CA	3	6	25421	25426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018744	AT	3	6	25427	25432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018744	CTA	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018744	AC	3	6	25471	25476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018744	T	6	6	25499	25504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018744	A	6	6	25539	25544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018744	ACTT	2	8	25550	25557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018744	CGC	2	6	25616	25621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018744	A	6	6	25663	25668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018744	GAA	2	6	25725	25730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018744	TTG	2	6	25753	25758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018744	A	8	8	25772	25779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018744	GTA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018744	TGGA	2	8	28578	28585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018744	ATT	2	6	29917	29922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018744	ATT	2	6	29925	29930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018744	T	6	6	29962	29967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018744	AT	3	6	30022	30027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018744	ATTAG	2	10	32768	32777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018744	TATAAT	2	12	32778	32789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018744	TAT	2	6	32802	32807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018744	ATT	2	6	32817	32822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018744	A	7	7	32837	32843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018744	ATT	2	6	32876	32881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018744	A	6	6	32914	32919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018744	AAT	2	6	34007	34012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018744	AGT	2	6	34025	34030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018744	AATT	2	8	34083	34090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018744	ATA	2	6	34122	34127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018744	ATT	2	6	34154	34159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018744	ATT	2	6	34195	34200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018744	ATT	2	6	35861	35866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018744	TGAC	2	8	35867	35874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018744	TATT	2	8	35882	35889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018744	AAT	2	6	35894	35899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018744	ATTAA	2	10	35984	35993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018744	A	7	7	35995	36001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018744	ATTT	2	8	36007	36014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018744	A	7	7	36015	36021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018744	ATT	2	6	36115	36120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018744	T	7	7	36132	36138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018744	ATTT	2	8	36194	36201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018744	TAA	2	6	36234	36239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018744	AGC	2	6	36264	36269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018744	AT	3	6	36339	36344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018744	AAT	2	6	36360	36365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018744	ATTTT	2	10	36377	36386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018744	TAA	2	6	36466	36471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018744	GTT	2	6	36477	36482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018744	ACT	2	6	36484	36489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018744	TTTC	2	8	36497	36504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_018744	ACC	2	6	36550	36555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_018744	TTA	2	6	36566	36571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018744	AG	3	6	36638	36643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018744	TTC	2	6	36655	36660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_018744	CCTT	2	8	36673	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_018744	TGA	2	6	36705	36710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018744	AGC	2	6	36760	36765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_018744	TTG	2	6	36843	36848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018744	CCT	2	6	36884	36889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_018744	CGG	2	6	36900	36905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_018744	TCG	2	6	36998	37003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_018744	T	6	6	37013	37018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018744	TCAT	2	8	37022	37029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_018744	AATCC	2	10	37042	37051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
173	NC_018744	TAC	2	6	37083	37088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_018744	CAA	2	6	37095	37100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_018744	T	6	6	37102	37107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018744	A	7	7	37143	37149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018744	GAAA	2	8	37152	37159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018744	GTTT	2	8	37161	37168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018744	T	6	6	37185	37190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018744	TTC	2	6	37218	37223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_018744	CAC	2	6	37244	37249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_018744	TGT	2	6	37297	37302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018744	TAA	2	6	37320	37325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018744	AATT	2	8	37520	37527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018744	ACT	2	6	37561	37566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_018744	T	6	6	37584	37589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018744	GCT	2	6	37654	37659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_018744	ATC	2	6	37827	37832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_018744	TAC	2	6	37842	37847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_018744	ATA	2	6	37909	37914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018744	TAA	2	6	37983	37988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_018744	A	7	7	38006	38012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_018744	TA	3	6	38013	38018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018744	A	6	6	38026	38031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018744	TAA	2	6	38033	38038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018744	A	6	6	38068	38073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018744	AAT	2	6	38135	38140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018744	ATT	2	6	38157	38162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018744	ATT	2	6	38187	38192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_018744	TACC	2	8	38230	38237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
202	NC_018744	AAAT	2	8	38269	38276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_018744	TAA	2	6	38286	38291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_018744	A	7	7	38317	38323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_018744	TGT	2	6	38364	38369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
206	NC_018744	TACTC	2	10	38410	38419	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
207	NC_018744	AACTTT	2	12	38537	38548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.